Uitgelegd: B.1.617-variant en de Covid-19-golf in India

Genoomsequencing-gegevens hebben het bewijs geleverd van de 'dubbele mutant' in 61% van de monsters in Maharashtra. Maar of deze nieuwe variant de aanhoudende golf van India aanstuurt, kan pas worden gezegd als er meer gegevens beschikbaar zijn.

Gezondheidswerkers maken bedden klaar in de Shehnai Banquet Hall in New Delhi, die is omgebouwd tot een tijdelijke afdeling voor Covid-9-patiënten. (Express Foto: Amit Mehra)

Tijdens een bijeenkomst met districtslaboratoria in Maharashtra vorige week, deelde het National Institute of Virology (NIV) beperkte gegevens die een uiteenvallen aantonen van 361 genoomsequenties die tussen januari en maart van dit jaar zijn verzameld.

De kop bevinding van de analyse : in 220 — bijna 61 procent — van de monsters werd de aanwezigheid van een dubbele mutatie gedetecteerd. Deze dubbele variant is vorige week geclassificeerd als de B.1.617 variant.

Nieuwsbrief| Klik om de beste uitleg van de dag in je inbox te krijgen

Wat is de B.1.617?

De B.1.617-variant van SARS-CoV-2 draagt ​​twee mutaties, E484Q en L452R. Beide worden afzonderlijk aangetroffen in veel andere varianten van het coronavirus, maar zijn voor het eerst samen gemeld in India.

De twee mutaties worden gevonden in het spike-eiwit van het virus. Het spike-eiwit helpt het virus zich te binden aan de receptoren van de menselijke cel en toegang te krijgen tot een gastheercel.

De E484Q-mutatie is vergelijkbaar met E484K, een mutatie die is gevonden in varianten van het coronavirus in het Verenigd Koninkrijk (afstamming B.1.1.7) en Zuid-Afrika (B.1.351).

De L452R-mutatie is gevonden in snel verspreidende varianten in Californië (B.1.427 en B.1.429). Het kan de bindingskracht van spike-eiwitten met ACE2-receptoren op menselijke cellen vergroten, waardoor het beter overdraagbaar wordt. L452R kan mogelijk ook de virale replicatie versterken.

Samen zijn E484Q en L452R besmettelijker en kunnen ze antilichamen ontwijken.

Waar is de B.1.617 gevonden?

Er zijn beperkte gegevens. Het werd voor het eerst gemeld uit Maharashtra. In januari werden 19 monsters uit verschillende districten gesequenced en in vier werd B.1.617 gevonden. In februari werden 234 monsters gesequenced uit 18 districten en 151 monsters - uit ten minste 16 districten - hadden deze variant. En in maart hadden maar liefst 65 van de 94 monsters het.

Tot dusver hebben de districten Amravati, Nagpur, Akola, Wardha, Pune, Thane, Aurangabad en Chandrapur sterk bewijs geleverd van de aanwezigheid van B.1.617. In andere districten werden minder monsters gesequenced en in sommige werd de variant gevonden. Sequentie is in behandeling voor meer monsters.

WORD NU LID:The Express Explained Telegram Channel

Is deze variant virulenter?

Er is tot nu toe geen bewijs. De meeste patiënten kunnen thuisisolatie gebruiken, hoewel klinische ervaring moet worden gecombineerd met gegevens over genoomsequencing om wetenschappelijk bewijs te genereren. Klinische anekdotes van artsen suggereren dat de variant zich sneller verspreidt, besmettelijker is, hele families kan infecteren, maar minder virulent is en niet dramatisch meer ziekenhuisopnames veroorzaakt.

De meeste patiënten zijn asymptomatisch en dat is een goede indicatie. Maar in absolute aantallen hebben zoveel gevallen de gezondheidsinfrastructuur belast, zei dr. Shashank Joshi, een expert van de Maharashtra Covid Task Force.

Hoeveel heeft het zich verspreid?

Dr. Sujeet Singh, directeur van het National Center for Disease Control (NCDC) heeft erop gewezen dat tot nu toe zeer weinig monsters van Maharashtra zijn gesequenced, en het is te vroeg om definitieve conclusies te trekken over hoe wijdverbreid de dubbele mutant is. De centrale overheid had in maart echter gemeld dat 15-20 procent monsters in Maharashtra deze variant hadden; op basis van de laatste sequentiegegevens weten we dat dit aantal inmiddels boven de 60 procent ligt.

Artsen en districtsbeheerders in Maharashtra melden dat in tegenstelling tot de eerste golf, hele gezinnen besmet raken in de tweede golf. Dit zou erop kunnen wijzen dat fysieke afstand en isolatiemaatregelen in het huishouden onvoldoende zijn, of dat het virus meer overdraagbaar is geworden.

josh mankiewicz vrouw

Zou B.1.617 de aanhoudende toename van Covid-19-gevallen kunnen veroorzaken?

Dr. Gangandeep Kang, hoogleraar microbiologie aan het Christian Medical College, Vellore, zei dat 60,9 procent van de monsters die deze variant droegen hoogstwaarschijnlijk een verband vertoonden tussen de mutatie en de piek – maar voor een nauwkeurig antwoord moest minstens 1 procent van de Covid-19-monsters moet elke week worden gesequenced. Nu India momenteel meer dan 1 lakh-gevallen per dag test, zou dit zich vertalen in ongeveer 1.000 genoomsequenties per dag.

We moeten ook kijken naar hoeveel mensen een persoon kan infecteren en naar de RT-PCR-cyclusdrempel. We moeten live volgen. Gegevens van januari hebben weinig waarde in april, zei Dr. Kang.

Dr. Gautam Menon, professor aan de Ashoka University, Sonepat, en aan het Institute of Mathematical Sciences, Chennai, zei: wat we hebben is suggestief, maar we hebben meer gegevens over genoomsequenties nodig om te begrijpen welke variant het aantal nieuwe infecties in verschillende staten veroorzaakt... Om te suggereren dat de stijging van het aantal gevallen te wijten is aan deze variant met dubbele mutanten, zouden we meer tijdstippen moeten hebben. Als we bijvoorbeeld zouden kunnen zeggen dat we 30 procent van deze variant in monsters op 30 maart hebben gedetecteerd en vervolgens 40 procent in monsters op 14 april, zou dat erop wijzen dat de nieuwe variant de verspreiding van de ziekte domineert.

Ook dr. Menon onderstreepte de noodzaak van meer gegevenstransparantie. Het is mogelijk, hoewel steeds onwaarschijnlijker, dat de gevallen ook verband kunnen houden met de vorige stam, zei hij. Tenzij we weten in hoeverre de toename kan worden toegeschreven aan de nieuwe variant, kunnen we niet met zekerheid vaststellen of versoepelingen in Covid-passend gedrag met de oudere soort de toename hebben veroorzaakt of dat de verhoogde besmettelijkheid van de nieuwe variant verantwoordelijk is.

Prof Vinod Scaria, hoofdwetenschapper, CSIR -IGIB, was het ermee eens dat we niet met zekerheid kunnen zeggen dat deze varianten de golf van de tweede golf aansturen. Er zijn echter aanwijzingen dat, althans in sommige staten, de B.1.1617-afstamming overheerst en zou kunnen bijdragen aan de toename van het aantal gevallen, zei hij. Deze afstamming wordt gedefinieerd door 15 genetische varianten, waaronder zes spike-eiwitvarianten. Twee hiervan (E484Q en L452R) zijn betrokken bij immuunontsnapping en verhoogde besmettelijkheid, zei prof Scaria.

Kan de variant vaccins omzeilen?

Nogmaals, de gegevens zijn beperkt. Sommige mensen zijn inderdaad besmet na de eerste dosis, maar er zijn geen gegevens over of hun monsters zijn opgestuurd voor genoomsequencing.

We weten dat de Zuid-Afrikaanse variant beter in staat is om aan immuunrespons te ontsnappen. We weten dat de Britse variant de meest overdraagbare is. Maar we weten tot nu toe niets over B.1.617, omdat we geen gegevens verzamelen om conclusies te trekken, zei Dr. Kang.

Dr. Menon onderstreepte dat hoewel van vaccins niet wordt verwacht dat ze infectie voorkomen, ze zeker ernstige ziekte en overlijden voorkomen. We verwachten dat dit ook met de nieuwe variant zo zal blijven. De enige oplossing op middellange tot lange termijn om met Covid-19 om te gaan, is dat mensen zich laten vaccineren.

Deel Het Met Je Vrienden: