Uitgelegd: vijf stappen voor het detecteren van het coronavirus (COVID-19)

Het proces werd aan The Indian Express uitgelegd door Dr. V Ravi, Senior Professor & Head, Department of Neurovirology, NIMHANS.

Nepbloed wordt gezien in reageerbuizen die zijn gelabeld met het coronavirus (COVID-19) in deze illustratie, genomen op 17 maart 2020. (Reuters)

Dr. V Ravi, Senior Professor en Head, Department of Neurovirology, NIMHANS, legt het proces van het detecteren van het coronavirus uit om deze website . Dit zijn de vijf stappen:

Ophalen en transport

Mary King Charlie Rose

Het testcentrum neemt uitstrijkjes van de neusholtes en de achterkant van de keel (farynx) en plaatst monsters in een virustransportmedium dat uitgebalanceerde zouten en albumine bevat om te voorkomen dat het virus uiteenvalt. Het monster wordt vervolgens in een koude opslag naar het testlab getransporteerd.

Extractie van viraal RNA

Coronavirussen zoals de SARS-CoV (die in 2002-03 in China opdook), MERS-CoV (die in 2012 in Saoedi-Arabië verscheen), of de huidige SARS-CoV-2 die de COVID-19-pandemie heeft veroorzaakt, hebben grote , enkelstrengs RNA-genomen. Testlab haalt het RNA uit de monsters met behulp van in de handel verkrijgbare kits (zoals die gemaakt door bedrijven als QIAGEN).

HET RNA in DE PCR-mix plaatsen

Geëxtraheerd RNA wordt toegevoegd aan een mengsel van polymerasekettingreactie (PCR). Dit omvat de 'mastermix', die een 'reverse transcriptase'-enzym bevat dat het RNA omzet in DNA. Mastermix bevat Taq-polymerase, het enzym dat kopieën van het DNA, nucleotiden en andere elementen zoals magnesium maakt, waarvan een ion nodig is om het DNA te versterken.

De PCR-mix bevat ook ‘reagentia’ zoals ‘primers’ en ‘probes’. Primers zijn bepaalde DNA-strengen die zijn ontworpen om te binden met het DNA dat moet worden gekopieerd; sondes worden gebruikt om de specifieke sequentie in het DNA-monster te detecteren. De WHO heeft specifieke primers en probes aanbevolen voor het testen op COVID-19.

Ten slotte bestaat de PCR-mix uit een huishoudgen - een normaal menselijk gen (RNase P) dat wordt gebruikt om ervoor te zorgen dat monsters op de juiste manier werden verzameld en RNA werd geëxtraheerd.

AmpLificatie van het virale DNA

Het monster, in zijn PCR-mix, wordt in buizen of platen gedaan, die vervolgens in een thermische cycler-machine worden geplaatst die wordt gebruikt om het PCR-proces uit te voeren.

Eerst wordt het RNA omgezet in DNA. Dan begint het proces van het kopiëren van de genen. De thermische cycler verwarmt en koelt het mengsel met het monster, afwisselend tussen drie temperaturen - voor het smelten van het DNA om de twee strengen te scheiden, voor de primer om aan het DNA te binden en voor het synthetiseren van een nieuwe streng - allemaal binnen één cyclus die een minuut. De thermische cycler voert 30-40 van dergelijke cycli uit om het DNA te amplificeren om te controleren op het virus.

Testen tegen controles

Geamplificeerd DNA wordt getest tegen een positieve controle, die meestal bestaat uit genen van het virus die in plasmide zijn gekloond, en een negatieve controle, een 'bekend' monster dat eerder negatief op het virus heeft getest.

RNase P zou amplificatie moeten vertonen, positieve controle zou positief moeten zijn, negatieve controle zou negatief moeten zijn, en wat voor resultaat je ook krijgt voor het monster, het is het juiste resultaat, zei neuroviroloog Dr. V Ravi. Om ervoor te zorgen dat een test geldig is voordat het resultaat wordt vrijgegeven, moet aan bepaalde 'validiteitscriteria' worden voldaan.

kristen alderson netto waarde

Mis het niet uit Explained | Hoe de COVID-19-test werkt

Als het huishoudgen (RNase P) positief is, positieve controle positief, negatieve controle negatief is en het monster geen PCR-positief resultaat vertoont, wordt het monster negatief verklaard voor het SARS-CoV-2-virus-RNA. Als het PCR-resultaat positief is, heeft de patiënt COVID-19.

Deel Het Met Je Vrienden: