Uitgelegd: hoe de coronavirus (COVID-19) test werkt

Hoe kijkt de PCR-test naar het virus in uitstrijkjes? Hoe lang duurt het? Hoeveel monsters test India dagelijks en kan het meer testen? Als het kan, waarom is het dan nog niet opgeschaald?

India voert momenteel een realtime PCR in twee fasen uit om te testen op SARS-COV-2. (Reuters)

Wat is de diagnostische test voor het nieuwe coronavirus dat COVID-19 veroorzaakt?

De De Indiase Raad voor Medisch Onderzoek (ICMR) heeft de aangewezen laboratoria gezegd: zal gebruik maken van de conventionele real-time polymerasekettingreactie (PCR)-test, die wordt uitgevoerd op een uitstrijkje dat achter in de keel is verzameld, een vloeibaar monster uit de onderste luchtwegen of een eenvoudig speekselmonster. Dergelijke tests worden vaak gebruikt bij de detectie van Influenza A-, Influenza B- en H1N1-virussen.

Wat is de PCR-test?

Het maakt gebruik van een techniek die kopieën maakt van een DNA-segment. 'Polymerase' verwijst naar de enzymen die de kopieën van DNA maken. De 'kettingreactie' is hoe de DNA-fragmenten worden gekopieerd, exponentieel - één wordt gekopieerd in twee, de twee worden gekopieerd in vier, enzovoort. Kary Mullis, de Amerikaanse biochemicus die de PCR-techniek uitvond, kreeg in 1993 de Nobelprijs voor Scheikunde.

SARS-COV-2 is echter een virus gemaakt van RNA, dat moet worden omgezet in DNA. Hiervoor omvat de techniek een proces dat reverse transcriptie wordt genoemd. Een ‘reverse transcriptase’-enzym zet het RNA om in DNA. Kopieën van het DNA worden vervolgens gemaakt en geamplificeerd. Een fluorescerende DNA-bindende kleurstof, de probe genaamd, toont de aanwezigheid van het virus. De test onderscheidt SARS-COV-2 ook van andere virussen.

Hoe lang duurt het PCR-proces?

Real-time PCR's hebben de tijd die nodig is om monsters te testen teruggebracht tot 4,5 uur van ongeveer 6 uur eerder, zei ICMR-wetenschapper Dr. R R Gangakhedkar. De totale doorlooptijd - vanaf het moment dat de monsters worden verzameld tot het moment waarop het rapport wordt afgeleverd - is echter ongeveer 24 uur en zou korter moeten zijn, zei hij.

uitgelegd: Vijf stappen om het coronavirus te detecteren

Hoe wordt de test gedaan in India?

India voert momenteel een real-time PCR in twee fasen uit om te testen op SARS-COV-2, zei NIMHANS Senior Professor en Head of Neurovirology, Dr. V Ravi. De eerste fase is ontworpen om genetische elementen te detecteren die gemeenschappelijk zijn voor menselijke coronavirussen die in het monster kunnen voorkomen. De tweede fase is ontworpen om te testen op specifieke genen die alleen aanwezig zijn in het SARS-COV-2-virus.

Tot begin maart is de eerste screening alle laboratoria hebben een test gedaan om te controleren op elk type coronavirus, maar de bevestigende PCR is alleen uitgevoerd door het National Institute of Virology in Pune. Vervolgens heeft NIV Pune de technologie (reagentia die nodig zijn voor de bevestiging) overgedragen aan alle laboratoria, zodat er geen monster nodig zou zijn om helemaal naar Pune te gaan. Dit heeft de tijd verkort die nodig is om de monsters te testen, zei Dr. Ravi.

Coronavirus-testen: Er wordt nepbloed gezien in reageerbuizen die zijn gelabeld met het coronavirus (COVID-19) in deze illustratie, genomen op 17 maart 2020. (Reuters-illustratie: Dado RuvicO

Test India genoeg cijfers?

India heeft de capaciteit om dagelijks 10.000 monsters te testen en test momenteel ongeveer 600-700. Ter vergelijking: Zuid-Korea, dat een vergelijkbare doorlooptijd heeft, test naar verluidt tot 20.000 monsters per dag, vooral met behulp van modellen zoals de drive-through-testfaciliteiten.

De regering stelt dat het in dit stadium niet nodig is om iedereen te testen. Het land test het cohort dat het nu moet testen, zei dr. Gangakhedkar. Als je gelokaliseerde transmissie gebruikt, testen we genoeg. Als u denkt dat er sprake is van overdracht via de gemeenschap, dan is het een ander probleem. Er is nog steeds geen bewijs dat we niet weten hoe de indexzaak deze infectie heeft gekregen, zei hij.

eminem nettowaarde 2017

Express Explained staat nu op Telegram. Klik hier om lid te worden van ons kanaal (@ieexplained) en blijf op de hoogte van het laatste nieuws

We willen niet willekeurig testen omdat nu iedereen om een ​​test vraagt. Dus ergens zullen we het moeten rationaliseren ... maar het is ook belangrijk om in de gaten te houden, zodat we de overdracht door de gemeenschap niet missen, zei ICMR-wetenschapper Dr. Nivedita Gupta tijdens een persconferentie vorige week.

martha macisaac leeftijd

Wat zal de strategie zijn als gemeenschapsoverdracht plaatsvindt?

ICMR voert een surveillance uit op enig bewijs van overdracht door de gemeenschap, waarbij elk van de 52 testlaboratoria van India 20 willekeurige steekproeven van patiënten met ernstige acute luchtweginfectie (SARI) test. De 'eerste snede' van deze tests zal naar verwachting woensdag verschijnen. ICMR heeft gezegd dat, in het geval dat een geval van overdracht door de gemeenschap aan het licht komt uit deze bewakingstests, de strategieën van de overheid totaal anders zullen zijn.

Coronaviruspandemie: in een ziekenhuis in New Delhi. (PTI-foto/bestand)

Zijn er belemmeringen voor het opschalen van testen?

Kosten zijn een potentiële barrière, denken sommige experts. ICMR-functionarissen hadden tijdens een conferentie gezegd dat de kosten van een primaire test voor COVID-19 Rs 1.500 zijn. Als een tweede test moet worden gedaan om de resultaten van de eerste test te bevestigen, bedragen de totale kosten ongeveer Rs 5.000. Een van de functionarissen had ook gezegd dat de gebruikte sondes, die uit Duitsland worden geïmporteerd, een beperkende factor zijn.

Terwijl het aantal testcentra is toegenomen, is ook de invoer van sondes gestegen. Vorige week wilde India ongeveer 200.000 sondes importeren, terwijl Dr. Gangakhedkar maandag zei dat de regering van plan was ongeveer een miljoen te importeren.

Coronaviruspandemie: wanneer testen en met wie?

Zou India het anders doen?

Wat India was begonnen te doen, is precies wat werd aanbevolen voor een land waar de ziekte werd geïmporteerd, volgens de uitvoerend directeur van het Translational Health Science and Technology Institute India, dr. Gagandeep Kang. Het testen en opvolgen van degenen die het land binnenkomen, en het onder toezicht plaatsen van degenen met wie ze in contact zijn gekomen, is echter een rationele en geschikte benadering als het enige risico was dat de ziekte werd geïmporteerd, en de opvolging en het testen 100 %, ze zei.

Maar wat er kan gebeuren, is dat je met deze infectie al kunt afstoten voordat je symptomen ontwikkelt, en bij heel weinigen heb je misschien nooit symptomen, dus je zou het kunnen doorgeven aan andere mensen zonder te weten dat je besmet bent, zei ze. Dit soort complexiteit ... maakt het noodzakelijk om na te denken over het hebben van een back-upstrategie om te zien of je echt iets hebt gemist, zei ze. Er is meer dat we zouden kunnen doen.

Zal de ICMR-surveillance helpen?

De beslissing van ICMR is een goede stap, maar er zijn regio's die een dergelijke oefening dan zou weglaten, zei Dr. Kang. Als je elke week monsters van elk grieplaboratorium test, en als je er maar één positief vindt, zal dat je vertellen dat je veel hebt gemist, zei ze.

Volgens Dr. Kang is het mogelijk om wiskundige modellen te gebruiken om te begrijpen wat de overheid een redelijke kans zou geven om te bepalen of er al overdracht door de gemeenschap is. Ik denk dat het geweldig zou zijn om het soort model te hebben dat Singapore heeft, waar elke arts waar dan ook die een klinisch vermoeden had, zelfs als het niet aan de beschrijving voldeed, zijn patiënt mocht sturen voor een test, voegde ze eraan toe.

– Inbreng van Kaunain Sheriff M

Deel Het Met Je Vrienden: