Explained: wat zijn de Covid-19-varianten in India en verklaren ze de stijging?

Er zijn meer dan 320 monsters van het coronavirus gevonden die de Britse afstamming hebben in Punjab. Verklaart dit de recente stijging? En hoe wijdverbreid zijn de varianten in Zuid-Afrika en Brazilië, naast andere in India?

In een winkelcentrum in Pune (Express Foto: Ashish Kale, Bestand)

Er zijn meer dan 320 coronavirusmonsters uit Punjab gevonden de Britse afstamming , een verwijzing naar een nieuwe stam van het virus die in december in het VK was opgedoken, met genetische mutaties waardoor het zich sneller kon verspreiden. Dit is het meest voorkomende voorkomen van de Britse variant in de Indiase bevolking die tot nu toe is gevonden, en zou mogelijk de snelle toename van het aantal gevallen in Punjab in de afgelopen weken kunnen verklaren.

Nieuwsbrief| Klik om de beste uitleg van de dag in je inbox te krijgen

hoeveel is jeezy waard

Een regeringsverklaring op woensdag zei dat tot nu toe 736 monsters uit het hele land een Britse afstamming hadden. Afgezien van deze werden 34 monsters gevonden met de Zuid-Afrikaanse afstamming en één had de Braziliaanse afstamming. De Zuid-Afrikaanse en Braziliaanse varianten zijn twee andere dominante stammen van het coronavirus die over de hele wereld circuleren. Door de genetische mutaties in deze twee varianten is de kans groter dat ze aan het menselijke immuunsysteem ontsnappen. De vrees is daarom dat de huidige vaccins relatief minder effectief tegen hen zouden kunnen zijn, hoewel dit nog steeds wordt onderzocht.

Varianten in India

De Britse, Braziliaanse en Zuid-Afrikaanse varianten zijn niet de enige die momenteel in de Indiase bevolking circuleren. Net als elk ander organisme muteert ook het coronavirus voortdurend, waarbij in elke replicatiecyclus enkele veranderingen in de genetische structuur plaatsvinden. De meeste van deze mutaties zijn onbelangrijk en veranderen de algemene aard of het gedrag van het coronavirus niet. Maar een paar van hen, mogelijk één op de duizenden, kunnen belangrijke veranderingen doorvoeren, waardoor het virus zich kan aanpassen of beter kan overleven.

Tijdens deze epidemie worden drie soorten veranderingen scherp in de gaten gehouden: veranderingen die het vermogen van het virus om zich sneller te verspreiden vergroten, veranderingen die een ernstiger ziekte bij de geïnfecteerde persoon veroorzaken en veranderingen die het virus helpen te ontsnappen aan de immuunrespons.

De varianten in het VK, Brazilië en Zuid-Afrika zijn zulke soorten. Elk van hen heeft nu zijn eigen families, wat betekent dat er veel latere mutaties in deze zijn geweest, maar waarbij de oorspronkelijke bepalende mutatie intact is gebleven. Deze drie variante families, of geslachten, zijn gevonden in meerdere landen en zijn voornamelijk verantwoordelijk voor de toename van het aantal gevallen in Europa en Brazilië.

Naast deze circuleren er verschillende andere varianten onder de Indiase bevolking, die met lokaal ontstaan evenals anderen die zijn meegebracht door reizigers uit het buitenland. Maar geen van deze is geclassificeerd als een zorgwekkende variant.

Covid-19-varianten gedetecteerd in India

UK Covid-19-variant en zorgen

Wetenschappers hebben volgehouden dat geen van de drie 'zorgwekkende varianten' - VK, Braziliaans of Zuid-Afrikaans - in verband kan worden gebracht met de huidige stijging van het aantal gevallen in India. Hun prevalentie in de gemeenschap is vanaf nu niet zo hoog dat de huidige stijging aan hen kan worden toegeschreven.

Zelfs in Punjab, waar 80% van de 400 geanalyseerde monsters de Britse variant bleek te zijn, is het te vroeg om de schuld te geven aan de buitengewone stijging van het aantal gevallen in de afgelopen weken. De resultaten van genoomsequencing zijn nu onthuld en er moet een klinische correlatie worden uitgevoerd om te beoordelen of ze verantwoordelijk zijn voor de toename van het aantal gevallen.

Zoals wetenschappers hebben opgemerkt, als de mensen die besmet zijn met de Britse stam in Punjab allemaal reizigers zijn, of hun directe contacten, dan kunnen hun gebeurtenissen gemakkelijk worden verklaard en zijn ze niet al te zorgwekkend. Als het echter ook bij mensen in de bredere gemeenschap is gevonden, bestaat het gevaar dat het zich zeer snel naar anderen verspreidt. Het zou ook betekenen dat de isolatie- en quarantaineprocedures die in de staat worden gevolgd, vooral voor reizigers, niet erg strikt zijn gevolgd.

jenna dewan tatum netto waard

Een paar specifieke mutaties die zijn gevonden in de Britse stam, zoals een genaamd E484Q en een andere genaamd N440K, zijn ook in sommige andere varianten waargenomen, en deze circuleren al enkele maanden in de Indiase bevolking. Op dit moment zijn er geen aanwijzingen dat een van deze tot de tweede piek zou kunnen leiden of herinfectie bij patiënten zou hebben veroorzaakt.

Er is echter veel gedetailleerder wetenschappelijk onderzoek nodig om de impact ervan op de verspreiding van de ziekte in India te beoordelen.

Genoomsequencing...

India heeft het op één na hoogste aantal mensen dat tijdens de epidemie is besmet met het coronavirus. Maar het heeft maar heel weinig genoomsequenties gemaakt van de verschillende varianten die in omloop zijn. Tot nu toe heeft het genanalyse uitgevoerd van 19.092 monsters uit het hele land, volgens een verklaring die de regering vorige week in het parlement heeft afgelegd. Dit omvat de sequencing van 10.787 monsters sinds de regering in december speciaal voor dit doel INSACOG (Indian SARS-CoV2 Consortium on Genomics) oprichtte. Veel andere landen, waaronder de Verenigde Staten en China, hebben meer dan 100.000 gensequenties geanalyseerd.

Het bestuderen van genetische veranderingen in het organisme is belangrijke aanwijzingen om de oorsprong, overdracht en impact van het virus op patiënten te begrijpen. Het verklaarde doel van INSACOG is om de monsters van ten minste 5% van alle geïnfecteerde gevallen te sequencen via een netwerk van tien laboratoria. Dat lijkt op dit moment een erg grote opdracht. India heeft tot dusver meer dan 1,17 crore positieve gevallen geregistreerd. De 19.092 samples die tot nu toe zijn gesequenced, vormen slechts 0,16% van dat aantal.

WORD NU LID:The Express Explained Telegram Channel

... en waarom het zo langzaam ging

scooter braun netto waard 2019

Een van de belangrijkste redenen voor het trage tempo van genoomsequencing is een gebrek aan geld. Tot nu toe is er geen geld toegewezen aan INSACOG, hoewel functionarissen zeiden dat goedkeuring voor fondsen nu elke dag kan worden verwacht. De laboratoria hebben geld uit hun eigen jaarlijkse budgetten gebruikt om het sequentiëringswerk te doen. Het duurt tussen Rs 3.000 en Rs 5.000 om de gensequentie van één monster te extraheren. De kosten zijn voornamelijk van de chemische reagentia die nodig zijn in het proces.

Ook hebben staten hun monsters niet proactief naar de laboratoria gestuurd voor sequencing. Maharashtra, dat tot nu toe meer dan 25 lakh-infecties heeft geregistreerd, heeft slechts ongeveer 2.800 monsters gestuurd voor sequencing, volgens overheidsgegevens die in het parlement zijn gepresenteerd. Dat is ongeveer 0,11% van alle gevallen. Kerala heeft het hoogste aantal monsters voor sequencing gestuurd, ongeveer 5.200, maar Karnataka, dat een vergelijkbaar aantal gevallen heeft, heeft slechts 137 monsters gestuurd. Een dergelijke lage snelheid van genoomsequencing is misschien niet statistisch significant om conclusies te trekken over de veranderende aard en het gedrag van het virus, of om geschikte interventies te ontwerpen om de verspreiding van de epidemie in te dammen.

Dit artikel verscheen voor het eerst in de gedrukte editie op 25 maart 2021 onder de titel ‘Cracking the virus strain’.

Deel Het Met Je Vrienden: