Uitgelegd: een overvloedige, zeer overdraagbare mutatie van het coronavirus begrijpen
Covid-19-mutaties: tot nu toe zijn 12.000 mutaties gedocumenteerd in meer dan 3,2 crore-gevallen wereldwijd. Eén mutatie is de meest voorkomende gevonden. Het werd voor het eerst opgemerkt in China en Duitsland.
RNA-virussen zoals SARS-CoV-2 muteren langzaam omdat ze een gastheer (menselijke cel) nodig hebben om te repliceren. (Bestandsfoto/representatief) Het coronavirus SARS-CoV-2 muteert voortdurend, maar één mutatie in het bijzonder heeft de aandacht van onderzoekers getrokken vanwege de overvloed. Deze mutatie, genaamd D614G, is beter overdraagbaar gebleken dan de meeste andere.
Wat is een D614G-mutatie?
Alle virussen muteren om zich aan te passen aan de barrières die mensen opwerpen. RNA-virussen zoals SARS-CoV-2 muteren langzaam omdat ze een gastheer (menselijke cel) nodig hebben om te repliceren.
Tot nu toe zijn 12.000 mutaties gedocumenteerd in meer dan 3,2 crore gevallen wereldwijd. Eén mutatie is de meest voorkomende gevonden. Het werd voor het eerst opgemerkt in China en Duitsland, maar kreeg aandacht toen het in verschillende gevallen opdook in Europa en uiteindelijk in de VS, Canada, Australië en India. Bij deze mutatie vervangt glycine (G) asparaginezuur (D) op de 614e positie in het aminozuur. Vandaar dat de mutatie 'D614G' werd genoemd.
IND614G,G (glycine) vervangt D (asparaginezuur) op de 614e positie. (Korberet al/Cel) Wat maakt deze mutatie anders dan andere?
Om dit te begrijpen, moeten we begrijpen hoe SARS-CoV-2 een menselijke cel binnendringt. De aminozuren waar mutatie optreedt, bevinden zich in het spike-eiwit van het virus. De spike-eiwitten binden zich met de ACE2-receptor op de menselijke cel en komen binnen.
Dr. Rajesh Pandey, wetenschapper aan het CSIR-Instituut voor Genomica en Integratieve Biologie, legt uit: Het zijn de peptiden in het spike-eiwit die zich hechten aan de ACE2-receptor. Bij de D614G-mutatie openen twee van de drie peptiden zich, waardoor de kans op toegang tot de menselijke cel groter wordt. Stel je een hand voor met drie vingers. Als slechts één vinger wordt geopend, heeft deze beperkte toegang om objecten op te pakken, maar als twee vingers worden geopend, kunnen ze meer objecten oppakken. De twee peptiden vergroten de kans dat het virus een menselijke cel binnendringt.
Omdat zijn aard een grotere kans geeft om een gastheercel binnen te gaan dan andere gemuteerde stammen, heeft D614G een hogere transmissiesnelheid. GISAID, een wereldwijde virusdatabase die alle circulerende stammen van SARS-CoV2 heeft gedocumenteerd, laat zien dat de gemuteerde stam vanaf maart aan belang won in Europa.
Express uitgelegdis nu aanTelegram. Klik hier om lid te worden van ons kanaal (@ieexplained) en blijf op de hoogte van het laatste nieuws
Wat zijn de implicaties hiervan?
Een virus muteert elke keer dat het zich vermenigvuldigt in de menselijke cel om zich aan te passen en te overleven. Deze mutatie helpt het virus precies dat te doen. Tot begin maart was deze mutatie zeldzaam, maar won ze aan dominantie in Europa, blijkt uit GISAID-gegevens.
jade thirlwall ouders
Een paper in Cell merkte op: Vóór 1 maart 2020 werd het (D614G) gevonden in 10% van 997 wereldwijde sequenties; tussen 1 maart en 31 maart 2020 vertegenwoordigde het 67% van 14.951 sequenties; en tussen 1 april en 18 mei 2020 vertegenwoordigde het 78% van 12.194 sequenties.
Een pre-print paper in Medrxiv vond dat patiënten die geïnfecteerd waren met deze mutatie een significant hogere virusbelasting hadden in de nasopharynx bij de eerste diagnose. De studie sequeneerde genomen van 5.085 SARS-CoV-2-stammen in Houston.
De stam is gegroeid, snel overgedragen vanwege het gemak waarmee het de cel binnenkomt. Dat is wat het een hype gaf, zei microbioloog dr. Jayanthi Shastri van Kasturba Laboratory, Mumbai. Shastri zei dat eerste onderzoeken aantoonden dat D614G zou kunnen leiden tot meer overdracht en ernstige symptomen. Aanvankelijk zagen we ernstige besmettelijkheid, maar naarmate de tijd verstreek, werd in onze monsters gezien dat infectiviteit niet direct in verband kan worden gebracht met mutatie, andere comorbide factoren spelen ook een rol, zei ze. Tot nu toe zijn er niet genoeg longitudinale onderzoeken om een direct verband te leggen tussen D614G en verhoogde mortaliteit. Daarvoor moeten we genoomsequencing doen voor verschillende ernstige patiënten om te controleren of deze mutatie aanwezig is, zei Shastri.
Ook in Uitleg | Nieuw onderzoek: calciumrijke neuszouten waarvan is aangetoond dat ze uitgeademde aerosol verminderen
Komt het veel voor in India?
The Lancet publiceerde een pre-print van Covid-19-herinfectie bij vier gezondheidswerkers in Mumbai. De studie van Kasturba Hospital, International Center for Genetic Engineering and Biotechnology en CSIR-Instituut voor Genomics en Integratieve Biologie vond in drie van hen een D614G-mutatie. Bij een arts die voor de tweede keer opnieuw geïnfecteerd raakte, was de D614G-mutatie aanwezig. Hij ontwikkelde ernstige symptomen en had plasmatherapie nodig. Maar we kunnen er niet zeker van zijn dat D614G direct wordt gekoppeld aan de ernst van de infectie, zei Shastri.
Bij een andere arts was D614G aanwezig bij de eerste infectie, maar dit leidde niet tot ernstige symptomen.
Of de mutatie de dood kan veroorzaken, of kan worden aangepakt door vaccins, is niet volledig bekend. Sommige onderzoeken hebben aangetoond dat het niet leidt tot ernstige infectie in de longen.
Is het een vaccinatiedoel?
De overvloed biedt onderzoekers een kans om het mechanisme ervan te bestuderen en erop te richten. Pfizer werkt aan een vaccinkandidaat waarbij antilichamen het receptorbindende domein in het virus blokkeren. De Duitse proef met het vaccin heeft veelbelovende resultaten opgeleverd tegen de D614G-stam.
Een pre-print paper in Biorxiv op 2 september was optimistisch dat de mutatie de effectiviteit van een vaccin ertegen niet zou verminderen.
Deel Het Met Je Vrienden:
